如何選定qPCR實驗用純水儀?

文章出處:網絡 人氣:發表時間:2022-08-24

目前疫情的防控工作取得了階段性的成效,基於(yu) 實時熒光定量PCR的核酸檢測技術在新冠病毒快速鑒定及確診中發揮了重要作用。

什麽(me) 是實時熒光定量PCR?

實時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)技術,簡稱qPCR,是在PCR反應體(ti) 係中加入熒光物質(熒光染料或熒光標記的特異性探針),利用熒光信號積累實時監測整個(ge) PCR進程,最後通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。

與(yu) 普通PCR相比,實時熒光定量PCR技術是一次由定性技術向定量技術的飛躍。運用該項技術,可以對DNA、RNA樣品進行相對定量、絕對定量和定性分析。

實驗流程:

在實時熒光定量PCR實驗中,可以分為(wei) 樣本采集,RNA提取,RNA質量鑒定,反轉錄及數據分析幾個(ge) 步驟,在進行引物、模板的稀釋,試劑的配製和補足反應體(ti) 係時都會(hui) 用到水,水質量的好壞直接影響最終數據分析的結果。

水中的顆粒物,離子含量,有機物及細菌微生物等雜質對實驗都會(hui) 帶來影響,最值得關(guan) 注的因素有以下兩(liang) 個(ge) 方麵:

1. DNA酶和RNA酶

DNA酶和RNA酶能夠特異性地降解DNA和RNA。在進行實時熒光定量PCR時,去除這兩(liang) 種酶從(cong) 而保證提取的RNA和DNA樣本的完整性十分關(guan) 鍵。尤其在提取RNA的時候,RNA極易被降解。這是因為(wei) RNase非常穩定,且無處不在,用常規的高溫高壓蒸汽方法和蛋白酶抑製劑不能使所有的RNase完全失活。如果樣本中的核酸被降解,會(hui) 影響檢測結果的準確性,甚至造成假陰性檢測結果。

因此,實時熒光定量PCR實驗用超純水必須有效降低DNA酶和RNA酶的含量,減少對實驗的影響。

2. 鎂離子

實時熒光定量PCR實驗需要根據不同的引物對和模板確定最佳的鎂離子濃度。

Mg2+濃度過低,會(hui) 影響DNA聚合酶的活性,導致產(chan) 量降低,影響實時定量的敏感性;

Mg2+濃度過高,會(hui) 增加引物二聚體(ti) 的形成,這會(hui) 影響特異性。

因此,實時熒光定量PCR實驗用超純水必須控製Mg2+濃度,避免背景因素帶來的不確定性。

綜上,實時熒光定量PCR實驗推薦使用超純水,水質要求如下圖所示:

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